在确定重要性水平时，通常是以财务报表整体的一定比例作为基准，例如税前利润。如果公司在本年度亏损很小，确实可能导致计算出的重要性水平过低，这可能会使得较小的错报在审计中被认为是不重要的，从而可能影响审计的有效性。

在这种情况下，注册会计师可以考虑以下方法来处理： 1. 使用其他基准：如果税前利润不适宜，可以考虑使用其他财务指标作为基准，比如营业收入、总资产、所有者权益等，这些指标在公司亏损时可能更能反映公司的规模和风险。

1. 考虑历史数据：可以参考过去几年的盈利情况，选取一个更为稳定的盈利年份的数据作为基准，但需注意这可能不完全反映当前的经济状况。

2. 考虑未来预期：如果亏损是暂时的，可以基于对未来盈利状况的合理预期来设定重要性水平。

3. 考虑定性因素：除了金额大小，重要性还应考虑项目的性质。即使金额小，但如果错报涉及关键会计估计、关联方交易或法规遵守等重要事项，也可能需要被视为重要。

4. 调整百分比：在极端情况下，可以适当提高所选基准的百分比，以确保重要性水平具有足够的实质意义。

重要的是，注册会计师在确定重要性水平时应保持职业判断，并确保其能够提供合理保证的审计服务。