当子公司注销清算，母公司在合并报表时，应当按照企业会计准则进行抵消处理。根据准则，母公司与子公司之间的债权与债务项目应当相互抵销，同时抵销相应的减值准备。如果母公司承担了子公司的部分债务，这部分债务的账面价值与母公司实际支付的金额之间的差额，应当计入母公司的当期损益，通常反映在“营业外收入”科目，因为这是与正常经营无关的非经常性损益。

在合并报表时，与子公司相关的长期股权投资、长期债权投资等项目，应当与子公司所有者权益项抵消。如果母公司对子公司的长期股权投资账面价值超过子公司所有者权益账面价值，超出部分应确认为商誉或损失，反之，如果子公司所有者权益账面价值超过长期股权投资账面价值，则应确认投资损失。

在子公司注销清算过程中，与母公司合并报表时，需要考虑以下几点会计处理：

1. 母公司对子公司的长期股权投资应与子公司所有者权益抵消。
2. 子公司与母公司之间的债权债务应相互抵消。
3. 如果母公司承担了子公司的部分债务，这部分债务的账面价值与实际支付的金额之间的差额应计入当期损益。
4. 与子公司相关的资产和负债应按其在合并实体中的公允价值或账面价值进行抵消。
5. 如果子公司注销清算时仍有未实现的内部销售损益，这些未实现的内部销售损益也应予抵消。

需要注意的是，如果子公司注销清算导致的损失超过了母公司对子公司的长期股权投资账面价值，超出部分应确认为损失。同样，如果子公司注销清算导致的收益超过了长期股权投资账面价值，超出部分应确认为投资收益。

因此，母公司在合并报表时，需要根据这些原则进行抵消和调整，以反映合并后集团的财务状况。