在合并财务报表中，对于长期股权投资，如果存在评估增值，比如500万的牌照增值，这部分增值不会直接体现在合并财务报表中，因为合并报表只反映合并范围内公司的资产、负债、收入和费用。如果长期股权投资1500万是按照权益法核算的，那么在合并层面，通常会抵消母公司对子公司的长期股权投资与子公司所有者权益之间的差额。

在这种情况下，如果子公司实收资本为100万，而母公司的长期股权投资为1500万，其中包含500万的评估增值（牌照），合并报表的处理如下：

1. 首先，母公司的长期股权投资1500万中，100万对应子公司实收资本的部分在合并时不会发生变化。
2. 然后，超出实收资本的1400万（1500万-100万）部分，理论上应反映在子公司所有者权益的其他综合收益或其他相关科目中，但由于这部分增值是由于牌照的评估，它并不属于子公司所有者权益的常规组成部分，因此在合并报表中可能需要特殊处理。
3. 如果牌照增值500万是由于非同一控制下的企业合并，那么这500万应被视为商誉，按照企业会计准则第8号-资产减值的规定，商誉应当结合相关的资产组或资产组组合进行减值测试，并在合并报表中体现。
4. 如果牌照增值500万是由于同一控制下的企业合并，那么这500万应体现在合并日的资本公积中，而不是作为商誉。

在合并报表中，母公司的长期股权投资1500万与子公司所有者权益100万之间的差额1400万（包括500万的评估增值）会通过抵消处理，减少母公司的长期股权投资和增加合并商誉（如果是非同一控制下合并）或资本公积（如果是同一控制下合并）。实际的会计处理会涉及具体的会计分录，但这里提供的是一种概括性的理解。