当股东按照评估值退出并进行减资时，公司需要进行以下会计处理：

1. 首先，确认减资的金额，这通常会导致所有者权益的减少。借记“实收资本”或“股本”科目，表示注册资本的减少，金额等于股东退出的评估值。

2. 然后，根据股东的持股比例，将减资金额分配到各个股东。如果只有一个股东退出，可以直接处理；如果有多个股东，需要按照各自的持股比例进行分配。

3. 如果股东的退出价格高于其在账面上的原始投资，这部分差额应视为资本利得，可能需要计入“资本公积——资本溢价”科目。借记“银行存款”或其他相关资产科目，表示收到的退出款项，贷记“实收资本”或“股本”，以及“资本公积——资本溢价”。

4. 如果股东的退出价格低于其原始投资，且低于其在账面上的份额，可能涉及到资产减值。根据企业会计准则，如果长期股权投资的可收回金额低于其账面价值，应当确认资产减值损失，借记“资产减值损失”科目，贷记“长期股权投资减值准备”。

5. 在减资完成后，需要更新公司的股东名册和注册资本等相关记录。

请注意，具体的会计处理可能会因国家和地区的会计准则差异而有所不同，上述处理基于一般的企业会计准则。在实际操作中，应遵循当地适用的会计法规和公司法。