根据企业会计准则第14号——收入（2017）-第二章 确认-第四条，企业应当在履行了合同中的履约义务，即在客户取得相关商品控制权时确认收入。在判断企业是作为代理人还是主体时，应当考虑企业是否承担了商品或服务的主要风险和报酬，是否具有定价权，以及是否对商品或服务的履约负责等因素。

在本案例中，C公司对于除直升机租金部分之外的服务费具有定价权，并且在提供服务的过程中承担了主要的风险与报酬，对服务的履约也负责。这表明C公司在提供直升机服务时，对于服务的控制权具有主导地位，因此C公司在这部分服务中的角色更接近于主体而非代理人。

因此，对于C公司向A公司收取的服务费用中的直升机租金部分，由于是根据B和C公司之间的租赁合同确定的，C公司在这部分可能仅作为代理人行事，应当采用净额法确认收入。而对于除租金部分之外的服务费，由于C公司具有定价权，承担主要风险和报酬，并对服务履约负责，应当采用总额法确认收入。

综上所述，C公司在确认收入时，应当对直升机租金部分和其他服务费部分分别进行考虑，分别采用净额法和总额法进行收入确认。