根据企业会计准则第14号——收入（2017）-第二章 确认-第九条，企业应当在履行了合同中的履约义务，即在客户取得相关商品控制权时确认收入。同时，根据第三十九条，企业向客户预收销售商品款项的，应当首先将该款项确认为负债，待履行了相关履约义务时再转为收入。

在本案例中，C公司与B公司的合同更改后，C公司需要在将飞机用于其他活动前，征得A和B公司的书面同意。这一更改可能意味着C公司对飞机的使用权受到了限制，因为它需要获得A和B公司的同意才能将飞机用于其他目的。这可能影响C公司是否被视为控制了飞机的使用权，即是否能够主导飞机的使用并从中获得几乎全部的经济利益。

如果C公司在提供服务的过程中仍然承担主要风险和报酬，具有定价权，并且对服务的履约负责，那么C公司可能仍然被视为主体。在这种情况下，C公司应当按照总额法确认收入，即将向A公司收取的全部服务费用作为收入，并将支付给B公司的租金作为成本在利润表中列报。

然而，如果合同更改后，C公司对飞机的使用权受到显著限制，从而影响了其控制飞机的能力，C公司可能不再被视为主体，而是作为代理人行事。在这种情况下，C公司应当按照净额法确认收入，即仅确认其从A公司收取的服务费用中扣除给B公司支付的租金后的净额作为收入。

因此，C公司是否可以按照总额法确认收入，需要根据合同更改后的具体条款和实际情况，综合考虑C公司是否仍然控制飞机的使用权，以及是否承担主要风险和报酬等因素进行判断。