监管机构在认定是否使用净额法确认收入时，主要依据企业会计准则第14号——收入（2017）中的规定，特别是第三十四条，该条规定企业应当根据其在向客户转让商品前是否拥有对该商品的控制权来判断其身份是主要责任人还是代理人。如果企业在商品转让给客户前能够控制商品，那么它为主要责任人，应按照已收或应收对价总额确认收入。相反，如果企业仅为代理人，即在交易中不控制商品，而是代表其他方销售，那么它应当按照预期有权收取的佣金或手续费的金额确认收入，通常是已收或应收对价总额扣除支付给其他相关方的价款后的净额。

在审计过程中，注册会计师需要关注企业是否正确判断其在交易中的身份，并据此选择合适的收入确认方法。这包括但不限于审查合同条款、风险和报酬的转移、商品控制权的实际情况、以及与客户和第三方的交易关系。如果企业频繁发生经销商或加盟商的变动，或者存在异常的收入确认情况，注册会计师需要进行深入的分析和测试，确保收入确认符合会计准则的要求。

因此，监管机构会要求企业提供充分的证据来支持其采用净额法的合理性，并且审计师需要执行相应的审计程序来验证这一判断的准确性。如果企业滥用净额法来操纵利润，监管机构可能会采取措施，要求企业调整其会计处理。