在母子公司交叉持股的情况下，合并财务报表的处理如下：

1. 长期股权投资与所有者权益的抵销：
2. 母公司对子公司的长期股权投资与母公司在子公司所有者权益中所享有的份额相互抵销，同时抵销相应的长期股权投资减值准备。

3. 子公司持有母公司的长期股权投资应视为库存股，作为所有者权益的减项，列示在合并资产负债表的“所有者权益”项目下。

4. 内部交易的抵销：

5. 母公司与子公司、子公司相互之间的债权与债务项目应当相互抵销，同时抵销相应的减值准备。

6. 投资收益的抵销：母公司对子公司、子公司相互之间持有对方长期股权投资的投资收益应当抵销。

7. 少数股东权益的处理：

8. 子公司所有者权益中不属于母公司的份额，即少数股东权益，在合并资产负债表中以“少数股东权益”项目列示。

9. 库存股的处理：

10. 子公司持有母公司的股权视为库存股，不构成合并报表层面的少数股东权益，而是抵销处理。

11. 合并所有者权益变动表的编制：

12. 合并所有者权益变动表中，母公司对子公司的长期股权投资与子公司所有者权益中所享有的份额相互抵销，子公司持有母公司的长期股权投资以及子公司相互之间持有的长期股权投资按相应规则处理。

13. 资本公积的调整：

14. 如果子公司持有母公司的股权涉及资本公积的变动，应根据合并对价的账面价值与取得的被合并方所有者权益账面价值的份额之间的差额调整资本公积。

综上所述，母子公司交叉持股的合并抵消涉及多个会计科目和步骤，目的是消除内部交易的影响，真实反映企业集团的整体财务状况和经营成果。