在公司采购工厂的货物然后卖给另一家公司的情况下，开票流程通常涉及以下几个步骤：

1. 采购环节：
2. 当公司从工厂采购货物时，工厂应开具增值税专用发票给公司。公司根据发票上的信息，借记“在途物资”或“原材料”、“库存商品”等科目，贷记“应付账款”或“银行存款”等科目。

3. 如果涉及增值税进项税额，公司应借记“应交税费——应交增值税（进项税额）”科目。

4. 销售环节：

5. 当公司将货物卖给另一家公司时，公司需要开具增值税专用发票给买方。公司根据销售情况，借记“应收账款”或“银行存款”等科目，贷记“主营业务收入”科目。

6. 同时，公司需要计算并确认增值税销项税额，借记“应收账款”或“银行存款”等科目，贷记“应交税费——应交增值税（销项税额）”科目。

7. 税务处理：

8. 公司需要根据增值税专用发票上的信息，进行税务申报和缴纳。增值税的计算通常是销项税额减去进项税额。

9. 会计处理：

10. 在会计记录中，公司应确保所有的交易都有相应的凭证支持，如采购发票、销售发票等，并正确记录在会计账簿中。

11. 注意事项：

12. 确保所有的发票信息准确无误，包括商品名称、数量、单价、税率等。
13. 遵守当地的税法规定，确保税务处理的合规性。

通过上述步骤，公司可以确保在采购和销售过程中的开票和会计处理符合会计准则和税法要求。