根据企业会计准则第12号——债务重组（2019）的规定，如果债转股未能成功，即债务人未能将债务转为权益工具，那么债务人应当继续按照原有债务的条款进行偿还。如果由于对方公司注销导致债转股无法执行，那么这笔债务应当视为未发生变更，公司作为债务人应当按照原债务的账面价值继续确认，并根据具体情况，可能需要评估是否能够收回该笔债务，若认为无法收回或部分无法收回，应计提相应的坏账准备。

如果公司想要分批处理，可以根据债务的还款计划和对方公司的清算情况，合理估计可收回的部分，并据此进行账务处理。例如，可以先根据确定能够收回的部分进行账务调整，对于剩余部分，根据清算进程和预期回收情况逐期进行处理。但具体操作需要结合实际情况和会计政策来确定。

请注意，这种情况下，公司应当咨询专业会计师的意见，确保账务处理符合会计准则的要求，并保持账目的准确性。