母公司和分公司的纳税申报处理如下：

1. 母公司：通常作为独立的法人实体，母公司需要根据其自身的收入、费用和利润情况，按照企业所得税法的规定，向其注册地的税务机关申报并缴纳企业所得税。此外，母公司还需根据其经营活动产生的增值税，进行增值税的申报和缴纳。

2. 分公司：

3. 独立核算的分公司：如果分公司是独立核算的，它需要在当地税务机关进行纳税申报。这意味着分公司需要根据其在当地的销售收入、成本和费用，计算并缴纳流转税（如增值税）以及可能的地方税费。企业所得税方面，如果分公司不是独立法人，其所得税通常会在母公司处合并计算和申报，但需根据当地政策可能需要在当地预缴或按分配比例缴纳。
4. 非独立核算的分公司：非独立核算的分公司，其收入、费用和税负通常并入母公司统一计算，由母公司汇总申报企业所得税，但流转税（如增值税）仍可能需要在分公司所在地缴纳。

在处理分公司和母公司的税务时，要确保遵守当地税法和相关法规，同时关注是否有特殊税务处理政策，如税收优惠政策或特定的纳税申报流程。务必保持合规，并及时与税务机关沟通以确保正确申报。