个人股东直接卖出上市公司股份通常需要缴纳资本利得税。根据中国的个人所得税法，个人出售股票所得的资本利得需要缴纳个人所得税，具体税率可能因持有期限的不同而有所差异。

如果个人通过合伙企业间接持有并卖出股份，那么情况可能会有所不同。在这种情况下，合伙企业的收入（包括股票出售的收益）将首先在合伙企业层面缴税。合伙企业的税率可能取决于其性质和适用的税率。然后，合伙企业的合伙人（个人股东）在收到合伙企业的分配时，可能需要根据其个人所得税率再次缴税，这通常被称为“双重征税”。

在选择通过哪种方式卖出股份时，需要考虑多个因素，包括但不限于持股时间、税率、税收抵免、成本基础记录等。为了确定哪种方式的税收负担更轻，建议咨询税务专业人士，他们可以根据具体情况提供详细的税务规划建议。