如果两家子公司对同一长期待摊费用采用不同的摊销年限，可能存在以下风险：

1. 财务报告不一致：这可能导致合并财务报表中长期待摊费用的摊销情况不准确，影响财务报表的可比性和一致性。

2. 合规风险：根据企业会计准则，企业应确保会计政策的一致性。如果子公司间的摊销政策不一致，可能违反了这一原则，需要合理解释为何在不同子公司间存在差异。

3. 审计问题：审计师可能会关注这种差异，要求公司提供合理的解释和依据，以证明不同摊销年限的合理性。

4. 税务风险：税法通常要求费用的摊销与经济利益的消耗相匹配，如果摊销政策与税法要求不符，可能会引起税务机关的关注，导致税务调整和潜在的罚款。

5. 决策误导：不一致的摊销政策可能会影响管理层和投资者对公司业绩的理解，可能导致错误的决策。

因此，公司应确保对长期待摊费用的摊销政策有明确的依据，并在必要时在财务报告中充分披露这些差异及其原因。