根据企业会计准则，无形资产的摊销应当根据其与无形资产有关的经济利益的预期消耗方式进行。对于使用寿命有限的无形资产，应当在其使用寿命内采用系统合理的方法进行摊销。在这种情况下，A非专利技术的摊销应基于其预计的经济利益消耗方式，即产量法。

A. 由于A非专利技术用于S产品生产，其摊销额应计入生产成本，而不是其他业务成本，因此，选项A是不正确的。

B. 2×22年10月1日至年底，共生产1万件S产品，若预计生产S产品100万件，那么2×22年应摊销的金额为390万元（购买价款）除以100万件，每件摊销额为3.9万元。因此，2×22年生产的1万件S产品对应的摊销额为3.9万元，选项B是正确的。

C. 2×22年10月1日到年底，摊销3.9万元，因此2×22年末，无形资产账面价值应为390万元（购买价款）+10万元（注册登记费）-3.9万元（摊销额）=396.1万元，选项C是不正确的。

D. 预计净残值的变化确实会影响摊销额的计算，因为摊销额等于无形资产的账面价值除以预计的产量，所以预计净残值的变化会导致无形资产的账面价值发生变化，从而影响摊销额，选项D是正确的。

综上所述，不正确的表述有： A. 该项非专利技术摊销额应计入其他业务成本 C. 该项非专利技术2×22年末应列示于资产负债表的金额为396万元

正确的表述有： B. 该项非专利技术2×22年应计提的摊销额为3.9万元

因此，不正确的表述有A和C。