A公司减资10%意味着公司注册资本减少了500万元（注册资本的10%），因此，股东甲20%的股权对应应分得的减资额是公司减资总额的20%，即100万元（5000万元 * 10% * 20% = 1000万元 * 20% = 100万元）。然而，公司支付给股东的金额可能需要考虑股东原始投资的比例和其他财务报表项目，如盈余公积和未分配利润，但这部分信息通常不会直接影响减资的计算，除非公司章程或股东间有特殊协议规定需要考虑这些额外的留存收益。在大多数情况下，减资主要基于股东的原始出资比例。所以，理论上，A公司应支付甲公司100万元。但具体操作中，减资的实施和支付细节可能会涉及法律和合同的约束，可能需要咨询专业法律顾问和遵循相关法律法规进行。