在固定资产清理过程中，如果固定资产清理科目出现借方余额，这通常表示固定资产清理过程中的净损失，即清理费用超过了清理收入。根据企业会计准则，固定资产清理时，首先会将固定资产的账面价值（减去累计折旧和可能的减值准备）从“固定资产”科目转出，记入“固定资产清理”科目的借方，表示固定资产清理的开始。清理过程中可能发生的费用，如清理费用，也会记入“固定资产清理”科目的借方，这会导致该科目的借方余额增加。同样，如果清理过程中取得的收入，如出售残值或废旧材料的收入，会记入“固定资产清理”科目的贷方，从而减少借方余额。最终，如果清理完成后存在净损失，这个净损失会体现在“固定资产清理”科目的借方余额，直至该资产清理完成并结转至相应的损益账户，如“营业外支出”或“资产处置损益”。

因此，固定资产清理时，如果发生清理费用或损失，"固定资产清理"科目的借方余额会增加；如果有净收益，则借方余额会减少。