在合并财务报表中处理合并范围内关联方交易时，如果交易一方是一般纳税人，适用6%的增值税税率，而另一方是小规模纳税人，适用1%的征收率，那么在抵消这些交易时，需要考虑的是所得税的影响，而非增值税。根据增值税核算制度，小规模纳税人在取得销售收入时，允许在增值税应纳税额中全额抵减的费用，应当按照规定抵减应交增值税，并调整到管理费用。然而，由于这是针对增值税的处理，而不是与所得税相关的递延所得税处理。

在合并报表中，由于关联方交易通常涉及的是所得税问题，因为增值税已经在各自公司层面得到妥善处理。因此，当抵消未实现的内部销售损益导致的暂时性差异时，应使用购买方的税率，也就是小规模纳税人的1%税率，来确认递延所得税的计量。这样做是因为相关资产或负债的账面价值在合并报表中调整后，其计税基础的变化将在小规模纳税人的纳税申报表中体现。

总结来说，尽管增值税税率不同，但在合并报表的处理中，关键在于考虑所得税影响，即使用小规模纳税人的1%税率来处理因抵销内部交易损益产生的递延所得税。