根据个人所得税的相关规定，乙公司在计算5月份应预扣预缴的个人所得税时，需要考虑孙某在甲公司的收入和预扣预缴税款情况。乙公司在5月份预扣预缴个人所得税时，应当合并孙某在两家公司的全年综合所得，扣除允许的专项附加扣除和其他扣除项，然后适用相应的税率和速算扣除数来计算应纳税所得额。1月到3月甲公司已经预扣预缴了984.6元，这个数额应当在乙公司5月份的预扣预缴时一并考虑。

然而，由于我没有具体的税率表和扣除标准，无法提供精确的计算结果。但乙公司在5月份预扣预缴个人所得税时，需要确保孙某的累计预扣预缴税额正确无误。乙公司应该根据孙某5月份在乙公司的收入，加上甲公司预扣预缴的税款，以及孙某在乙公司的专项附加扣除，计算5月份的应纳税所得额，然后根据适用的税率表计算出5月份应预扣预缴的个人所得税金额。