资本增加和股份认购协议通常涉及公司发行新股或增加现有股东的出资。在会计处理上，以下是一些关键点：

1. 资本增加： 当公司增加注册资本时，新注入的资金会增加“实收资本”或“股本”科目。如果超过面值的部分，会记入“资本公积——资本溢价”科目。

2. 股份订阅协议： 根据协议，投资者支付的金额超过股票面值的部分也会记入“资本公积——资本溢价”。如果涉及发行费用，这些费用通常在发生时计入当期损益，而不是作为资本的一部分。

3. 非同一控制下的企业合并： 在此情况下，购买方支付的对价（包括发行的股份）的公允价值与所取得的净资产公允价值的差额，计入商誉或调整长期股权投资的初始成本。

4. 权益结算的股份支付： 如员工股票期权计划，公司在授予日会确认一项费用，记入“管理费用”，同时增加“资本公积——其他资本公积”。

5. 回购股票： 公司回购自己的股票，会减少“股本”，增加“库存股”科目。如果回购价格高于面值，超出部分会减少“资本公积——资本溢价”。

6. 资本公积的使用： 经股东会决议，资本公积可以转增资本，此时会从“资本公积”借记，贷记“实收资本”或“股本”。

在处理这些交易时，公司需要遵守企业会计准则，确保准确记录和报告资本结构的变化。