保险经纪公司在代理保险业务时，佣金收入的会计处理如下：

1. 收入确认：根据企业会计准则第14号——收入（2017年修订），保险经纪公司作为代理人，应在向客户转让商品前能够控制该商品时，按照预期有权收取的佣金或手续费的金额确认收入。佣金收入通常在保险合同生效且满足收入确认条件时确认。

2. 费用扣除：佣金收入应以不含增值税的收入减除20%的费用后的余额作为收入额。展业成本按照收入额的25%计算，这部分成本可以从收入中扣除。

3. 账务处理：当收到佣金时，借记“银行存款”科目，贷记“递延收益”科目。随后，在服务期内，按照服务提供进度或合同约定的期限，将递延收益摊销至“主营业务收入”科目。

4. 税费计算：佣金收入涉及增值税，保险经纪公司需要计算并缴纳相应税费。同时，根据个人所得税政策，保险营销员和证券经纪人的佣金收入属于劳务报酬所得，需要进行特定的个人所得税计算。

5. 收入调整：如果佣金收入需要调整，例如因客户退款或合同解除，相应的佣金收入应冲减或调整。

综上，保险经纪公司在代理保险业务时，佣金收入的会计处理应遵循收入确认的原则，扣除相关费用，并在服务期内摊销确认收入，同时考虑税费的影响。