根据企业会计准则第20号——企业合并-第二章 同一控制下的企业合并-第八条，合并方为进行企业合并发生的各项直接相关费用，应当于发生时计入当期损益。因此，在同一控制下的企业合并中，相关的手续费不能计入长期股权投资成本，而应计入当期损益。同样，在非同一控制下的企业合并中，根据企业会计准则第20号——企业合并-第三章 非同一控制下的企业合并-第十一条，购买方发生的对企业合并直接相关的费用也应于发生时计入当期损益。因此，无论是在同一控制下的企业合并还是非同一控制下的企业合并中，手续费都不能计入长期股权投资成本。