长期股权投资的公允价值变动根据不同的会计处理方法进入不同的科目：

1. 如果长期股权投资按照公允价值计量且其变动计入当期损益（例如，分类为交易性金融资产或指定为以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产），公允价值变动会进入“公允价值变动损益”科目。

2. 当长期股权投资采用权益法核算时，如果被投资单位的公允价值变动，且该变动是永久性的，那么在确认该变动时，会调整长期股权投资的账面价值，不会单独设立一个科目来记录公允价值变动。长期股权投资的账面价值会直接反映公允价值的增加或减少。

3. 如果长期股权投资在满足一定条件（如从金融工具转换为权益法核算）时，其公允价值与账面价值之间的差额，以及原计入其他综合收益的累计公允价值变动，会转入相应的损益类科目，如“投资收益”或“营业外收入”，并可能影响长期股权投资的账面价值。

4. 如果长期股权投资被认定为以公允价值计量且其变动计入其他综合收益的金融资产，其公允价值变动会记录在“其他综合收益”科目，直到满足特定条件转回损益。

具体会计处理应根据实际情况和适用的会计准则进行。