根据用户问题，该企业2018年初占用的土地总面积为25000平方米，其中托儿所占地1000平方米，其余为生产经营用地。6月购置的办公楼占地2000平方米。该企业所在地城镇土地使用税年税额为6元/平方米。

首先，计算生产经营用地和办公楼占地的总面积： 25000平方米（初始占地） - 1000平方米（托儿所占地） + 2000平方米（办公楼占地） = 26000平方米

然后，根据城镇土地使用税年税额计算应缴纳的城镇土地使用税： 26000平方米 × 6元/平方米 = 156000元

因此，该企业2018年应缴纳的城镇土地使用税为156000元。答案是D. 156000元。