在收购时，如果存在少数股东权益，商誉的计算方法如下：

1. 首先，确定购买方支付的对价，这包括现金、非现金资产、发行的股份等。
2. 然后，计算被购买方的可辨认净资产公允价值，这包括所有单独可辨认资产和负债的公允价值总和。
3. 商誉的金额等于购买方支付的对价减去被购买方可辨认净资产的公允价值。如果这个差额为正，那么就是商誉；如果为负，可能表示购买方获得了负商誉，这种情况相对罕见。

在合并财务报表中，商誉不包括子公司归属于少数股东的权益部分。因此，商誉的计算仅考虑母公司对子公司的投资部分。如果子公司在后续期间发生亏损，超过了少数股东在期初所有者权益中的份额，超出部分会继续冲减少数股东权益，而不是母公司的商誉。

在进行商誉的减值测试时，虽然合并财务报表中的商誉不包括少数股东权益对应的商誉，但在测试过程中，应将归属于少数股东的商誉部分考虑在内，以调整资产组的账面价值。如果资产组发生减值，应先抵减商誉的账面价值，然后根据合并日母公司的持股比例分摊商誉减值损失，确认归属于母公司的商誉减值损失。

简而言之，商誉的计算和处理需要考虑母公司的支付对价、被购买方的可辨认净资产以及母公司的持股比例，同时在减值测试时要考虑到少数股东权益的影响。