医疗器械行业在税务方面面临多种风险，主要包括以下几个税种的风险及应对措施：

1. 增值税：企业可能存在隐瞒销售收入、不按规定设置账簿以逃避增值税和企业所得税的风险。应对措施是建立健全财务制度，确保发票管理合规，遵守“两票制”规定。

2. 消费税：对于特定的医疗器械产品，企业可能需要缴纳消费税。风险在于不正确地计入成本或逃税。企业应确保在进口、委托加工和自产自用应税消费品时，正确处理消费税的会计处理。

3. 企业所得税：虚增利润或少计费用可能导致企业所得税风险。企业应确保利润真实，费用合规，定期进行税务自查。

4. 个人所得税：在支付销售佣金或回扣时，企业需代扣代缴个人所得税，避免违法行为。应建立完善的薪酬和税务管理系统。

5. 关税：进口医疗器械时，企业需准确计算和缴纳关税，遵守海关规定，避免因违规操作导致的罚款。

6. 其他税费：如城市维护建设税、教育费附加等，企业需按时缴纳，确保税务合规。

应对措施包括：

• 建立健全内部税务管理制度，提高税务合规意识。
• 定期进行税务自查和风险评估，及时发现并纠正问题。
• 与税务顾问合作，确保理解和遵循最新的税法规定。
• 对员工进行税务培训，提高税务知识水平。
• 保留完整的交易记录和文件，以便在税务检查时提供支持。

企业还应关注市场风险、信用风险和流动性风险等金融风险，根据企业会计准则第25号，披露相关信息，并进行敏感性分析，以评估和管理这些风险。