根据企业会计准则，企业向交易相对方支付佣金的，应当如实入账。因此，医疗器械企业向销售商支付的佣金应当记录在财务账簿中，并反映在利润表中。这种支出通常被确认为费用，例如，可以记入“销售费用”或“管理费用”，具体取决于这笔佣金是否与销售活动直接相关。返利部分，如果是基于销售数量或其他可变因素，属于可变对价，应当根据预期有权获得的最大返利金额调整合同总价，只有在相关不确定性消除且预计未来不会导致已确认的收入发生重大转回的情况下，企业才能将这部分返利作为收入的减少。如果返利形式为实物或未来采购的价格折扣，这可能被视为向客户提供的一项重大权利，应当按照附有额外购买选择权的销售进行会计处理。在商品符合收入确认条件时，企业需要估计返利的公允价值，并据此调整存货采购成本。