涉及的增值税问题主要包括以下几点：

1. 扣缴义务人账务处理：境内公司作为扣缴义务人，为境外公司代扣代缴增值税时，会借记“应交税费——代扣代交增值税”科目，实际缴纳时再从该科目转出，贷记“银行存款”。

2. 销售业务账务处理：境内公司销售时，涉及的增值税处理可能包括借记“主营业务成本”，贷记“应交税费——应交增值税（进项税额转出）”，如果退税额低于进项税额，还需进行相应调整。

3. 进项税额抵扣条件变化：如果购进的货物、服务等用于简易计税项目、免税项目等，其进项税额不能抵扣，需要做进项税额转出处理。

4. 购进不动产或在建工程：购进的进项税额可能需要分年抵扣，此时也需要相应的账务处理。

5. 不得抵扣的进项税额：如果购进的货物、劳务等用于不得抵扣增值税的项目，其进项税额需要转出，不能计入“应交税费——应交增值税（进项税额转出）”。

6. 出口退税处理：境内公司出口货物，如果实行“免、抵、退”办法，退税额低于进项税额的差额，需要调整“主营业务成本”，同时，按规定计算的“免抵退不得免征和抵扣税额”也要转入“主营业务成本”。

请注意，以上处理均需根据具体的增值税政策和企业的实际情况进行调整。