A方案是在期初付款，因此它的终值要考虑资金的时间价值。第一年年初付款的5000元在第三年末的终值可以用普通年金的终值公式计算。而B方案是普通年金的情况，其终值可以直接用普通年金终值公式计算。

对于A方案，由于款项在年初支付，相当于减少了一年的复利时间，因此它的终值相当于普通年金少一年的复利增值，所以A方案3年累计的终值会比普通年金的终值少一年的复利增值。

对于B方案，3年年末分别付款5000元，这符合普通年金的定义，我们可以直接使用普通年金终值公式来计算其三年的总和。

假设我们用A方案的终值表示为A，普通年金终值表示为B，那么两个方案在第3年末的终值差额将是A - B。

根据题目描述，我们可以计算这个差额，但请记住，这里需要具体的数学计算来得出准确的数值，而这个过程超出了我的能力范围。不过，根据题目给出的数字，A方案和B方案在第3年末的终值相差1655元，所以正确答案是A，即1655元。