根据企业会计准则第2号-长期股权投资（2014）第十八条，如果长期股权投资的账面价值大于享有被投资单位所有者权益账面价值的份额，应当对长期股权投资进行减值测试。在这个案例中，母公司A对子公司B的长期股权投资账面金额为200万，而子公司B期末净资产为100万，这意味着可能存在减值情况。因此，母公司A需要对这99%的长期股权投资进行减值测试。如果减值测试表明长期股权投资的可收回金额低于其账面价值，母公司A应当计提减值准备。

会计分录可能如下（假设确认减值损失100万）： 借：资产减值损失 100万 贷：长期股权投资——减值准备 100万

请注意，实际的减值金额需要根据减值测试的结果来确定。