根据企业会计准则，同一控制下的企业合并，是指参与合并的企业在合并前后均受同一方或相同的多方最终控制且该控制并非暂时性的。当B公司注销，其业务转移给C公司，且这一过程发生在同一控制下时，A公司在母公司层面对于B公司的长期股权投资应当按照B公司在注销时点的账面价值，调整为对C公司的相应股权投资，同时，应将B公司账面上的净资产（包括商誉）按合并日的账面价值转移到C公司。这一处理体现了合并财务报表中持续经营假设的应用，避免了资产的重复计量。具体会计处理时，A公司应将对B公司的长期股权投资账面价值转为对C公司的长期股权投资，差额调整资本公积，若出现借方差额，则冲减资本公积，不足冲减的，依次冲减盈余公积和未分配利润。