企业代其从业人员或者他人负担的税款，如个人所得税，通常不允许在企业所得税前扣除。根据《企业所得税法》的相关规定，个体工商户代其从业人员负担的税款，不得在税前扣除（国家税务总局令第35号《个体工商户个人所得税计税办法》第三十条）。这意味着，如果项目所在地的企业代付了个人所得税，这部分支出不能作为企业的税前扣除项。

然而，企业支付的与取得收入直接相关的合理工资薪金支出，包括按规定代扣代缴的个人所得税，是允许在企业所得税前扣除的（国家税务总局江苏省税务局网站税前扣除相关规定）。因此，如果是企业正常代扣代缴的员工个人所得税，这部分支出在计算企业所得税时是可以扣除的。

请注意，具体的税务处理应以当地税法和税务机关的最新规定为准。