控制权转移的证明文件通常包括但不限于以下几种：

1. 股权转让协议：这是证明股东之间发生股权交易的法律文件，详细列明了转让的股权数量、价格、付款条件等。

2. 股东会决议：股东会通过决议同意股权的转让，这通常需要所有相关股东的签名或投票记录。

3. 工商变更登记：在政府部门完成的股权变更登记，包括变更后的公司章程、营业执照副本等，证明公司股东结构的变化已被官方记录。

4. 证券交易所的通知或确认：如果涉及上市公司，可能需要证券交易所的确认文件，证明股权已过户。

5. 支付证明：如银行转账记录、收款收据等，证明股权转让款项已支付。

6. 审计报告：在某些情况下，审计师可能会出具报告，确认控制权转移的财务影响。

7. 法律意见书：律师或法律顾问提供的法律意见，确认交易的合法性及控制权转移的效力。

8. 税务文件：可能包括税务登记变更、印花税缴纳凭证等，证明相关税务事项已处理。

这些文件共同构成了控制权转移的完整证据链，确保交易的合规性和可追溯性。