IFAC的三个层面的重要性确定方式如下：

1. 财务报表整体的重要性：通常由审计师根据企业的规模、行业特点、财务状况和经营结果等因素设定。它是一个基准，用于确定可能影响财务报表使用者决策的错报水平。整体重要性水平可以通过财务报表项目的金额占总资产、总负债、所有者权益、营业收入或净利润等比例来确定，并考虑项目的性质。

2. 实际执行的重要性：低于财务报表整体重要性，是审计过程中实质性测试的实际操作标准。它旨在允许审计师忽略一些小的错报，而不影响审计意见。实际执行重要性的确定考虑了审计效率和效果的平衡，通常基于整体重要性的一定百分比。

3. 特定类别的交易、账户余额或披露的重要性：针对财务报表中的特定项目，如高风险领域或对决策影响大的项目，可能需要设定更高的重要性水平。这取决于项目的性质，如其对财务报表的影响、潜在的错报风险，以及是否属于企业的关键业绩指标。

在确定这些重要性水平时，审计师需要运用专业判断，并考虑所有相关事实和情况，包括企业环境的变化、行业标准和法律法规要求。重要性原则的应用旨在确保提供的财务信息对决策者是有用的，同时保持审计工作的效率。