从财务角度来看，A公司收到B公司1000万并记录在其他应付款中，且这笔款项三年未发生变化，可能存在以下风险：

1. 流动性风险：长期占用这笔款项可能导致A公司的流动资金管理出现问题，影响日常运营资金的周转。

2. 会计处理风险：根据企业会计准则，长期挂账的其他应付款可能需要进一步审查，确保其合规性。如果这笔款项实质上是一种长期投资或贷款，可能需要重新分类或调整会计处理。

3. 税务风险：如果这笔款项未按税务规定进行税务处理，比如未申报利息收入或未支付利息支出，可能引发税务合规问题。

4. 审计风险：在年度审计时，这笔长期未动的其他应付款项可能会成为审计关注点，需要提供充分合理的解释和证据。

5. 法律风险：如果这笔款项的性质和使用不符合合同约定或法律法规，可能引发法律纠纷，特别是如果A公司未能按时偿还或未明确还款计划。

6. 管理运营风险：长期未解决的内部资金占用可能影响集团内部的资源配置效率，也可能损害集团内部的信任关系。

针对以上风险，A公司应采取以下措施：

• 明确款项性质：与B公司沟通，明确这笔款项的性质，是借款、预付款还是其他类型的资金往来，并据此进行正确的会计处理。

• 制定还款计划：如果这笔款项是借款，应制定并执行还款计划，避免长期占用。

• 税务合规：根据款项性质，确保相关的税务处理符合税法规定，如需支付利息，应及时进行税务申报。

• 完善内部流程：加强内部财务管理，避免类似长期挂账的情况再次发生，确保财务报表的准确性和完整性。

• 法律咨询：如有必要，寻求法律意见，确保所有操作都符合法律规定，避免潜在的法律纠纷。

• 审计沟通：在年度审计时，提前与审计师沟通这笔款项的情况，提供相关支持文件，确保审计过程顺利。