根据会计准则，企业在支付预付款时，应当按照实际支付的金额进行账务处理，并要求供应商开具相应金额的发票。发票的金额应当与实际交易相符，这是税务合规的基本要求。对方提到的按照工程进度开发票可能是考虑到工程款的支付与工程完成度相关，但这并不影响预付款发票的开具。预付款是提前支付的部分款项，理应根据实际支付的金额开具发票。

您可以这样解释：按照财务和税务规定，无论行业惯例如何，支付的每一笔款项都应当有对应的发票，以反映真实的经济交易。预付款是合同执行的一部分，应当按照实际支付的金额开具发票，这不仅有助于双方准确记录财务状况，也符合税务管理的要求。如果按照工程进度开具发票，那应该是在后续工程款支付时的操作，而不是针对预付款。因此，请求对方按照实际预付款金额开具发票是合理的，并且是符合财务规范的。