根据企业所得税法及其实施条例，企业应依法纳税，合理避税是指在遵守税法的前提下，通过合法手段减少税收负担。有限责任公司可以通过以下方式合法降低税收：

1. 利用税收优惠政策：企业可以充分利用国家提供的各种税收优惠政策，如高新技术企业优惠、小型微利企业优惠、研发费用加计扣除等。

2. 合理规划成本费用：确保所有符合条件的支出都被准确记录并作为成本费用扣除，如工资、租金、折旧、摊销等。

3. 投资免税或低税领域：投资于政府鼓励的行业或项目，如基础设施、环保项目等，可能享受税收减免。

4. 分期收款与预收款管理：根据收入确认原则，延迟收入确认时间可能会影响纳税年度的应纳税所得额。

5. 合理运用税收协定：如果公司在国际交易中，可以利用税收协定避免双重征税。

6. 建立合理的财务结构：通过债务和股权融资的比例调整，可能会影响利息支出的税前扣除和股息的税收待遇。

7. 税务筹划：在合法范围内提前规划业务活动，以优化税收负担，但需确保筹划方案符合税法规定。

请注意，合理避税需要在合法范围内进行，任何企图逃避税收的行为都将被视为违法行为，可能导致罚款甚至刑事责任。企业应咨询专业税务顾问，确保采取的措施符合税法要求。