未将合同中包含的多项可单独区分的履约义务分别确认费用，可能会导致以下风险：

1. 财务报告不准确：根据企业会计准则，企业应当识别合同中的各项履约义务，并分别确认收入和费用。如果未能这样做，可能会导致收入和费用的错配，从而影响利润表的准确性。

2. 税务风险：税务机关可能根据正确的收入确认原则进行审计，如果发现企业未正确识别和确认履约义务，可能会要求调整应纳税所得额，从而产生税务纠纷或罚款。

3. 审计问题：外部审计师在审计过程中会检查收入确认的准确性，未正确处理的履约义务可能导致审计调整，甚至影响审计意见。

4. 法律风险：如果错误的收入确认导致投资者或债权人决策失误，企业可能面临法律诉讼。

5. 误导市场参与者：不准确的财务报告可能误导投资者和其他市场参与者，影响他们对企业业绩的评估。

因此，企业必须遵循会计准则，正确识别和处理合同中的各项履约义务，以确保财务报告的合规性和透明度。