员工股票期权的账务处理根据企业会计准则第11号——股份支付（2006）进行。对于以权益结算的股份支付，如股票期权，如果授予后立即可行权，应在授予日按照权益工具的公允价值计入相关成本或费用，相应增加资本公积。在等待期内，企业需要按照员工的服务期限，将股票期权的公允价值分摊确认为费用。行权日，企业根据实际行权的权益工具数量，计算确定应转入实收资本或股本的金额，将其转入实收资本或股本。

对于以现金结算的股份支付，如模拟股票期权，授予后立即可行权的，应当在授予日以企业承担负债的公允价值计入相关成本或费用，相应增加负债。

在处理员工股票期权时，企业需要合理估计未来解锁条件的满足情况，并根据估计的解锁比例来分摊成本。如果后续信息表明不可解锁限制性股票的数量与以前估计不同，应当作为会计估计变更处理。实际行权时，根据行权情况调整相关会计科目。