当公司使用回购的库存股进行员工股权激励时，会计处理如下：

1. 公司授予员工限制性股票，不涉及新的资金流入，因此不需要借记“银行存款”。此时，借记“库存股”科目，表示库存股的减少，同时贷记“资本公积——其他资本公积”科目，金额为授予的股票公允价值。

2. 在等待期内，根据《企业会计准则第11号——股份支付》的规定，公司将按照权益工具的公允价值，将职工服务成本在等待期内分摊，借记相关成本费用科目（如“管理费用”），贷记“资本公积——其他资本公积”。

3. 如果股票未达到解锁条件而被回购，公司应转销库存股，借记“资本公积——其他资本公积”科目，贷记“库存股”科目，同时，借记“资本公积——其他资本公积”或“资本公积——股本溢价”科目，以冲减之前确认的资本公积。

4. 如果股票满足解锁条件，员工行权，库存股不再存在，不需要进行会计处理，因为库存股已经在授予时转销至“资本公积——其他资本公积”。

这些处理遵循了企业会计准则对库存股和股份支付的规定。