A公司在收到B公司支付的9万佣金时，应将其作为其他业务收入处理，并相应结转销售费用。会计分录如下：

1. 收到佣金时：

借：银行存款       90,000
贷：其他业务收入   90,000

1. 如果A公司为获取这笔佣金产生了相关费用，比如支付给销售人员的提成，可以记录在销售费用中：

借：销售费用——佣金支出   X (假设X为实际发生的费用)
贷：银行存款/应付职工薪酬等  X

这里的X代表实际发生的佣金支出金额。如果A公司没有其他相关费用，那么就不需要第二步的分录。

请注意，根据企业会计准则，佣金收入应当在实际收到时确认，而不是在合同签订或其他时间点。同时，如果佣金涉及增值税，还需考虑相应的销项税额处理。