当企业开具银行承兑汇票并支付40%的保证金时，会计分录如下：

1. 借：其他应付款 —— 保证金（或类似科目） 贷：银行存款

在承兑汇票到期，银行收取剩余60%的金额时，企业需要记录这一未来支付义务，会计分录如下：

1. 借：一年内到期的非流动负债 —— 未来支付的60%金额（假设） 贷：其他应付款 —— 承兑汇票款

当实际支付这笔款项给银行时，会计分录为：

1. 借：一年内到期的非流动负债 —— 未来支付的60%金额 贷：银行存款

请注意，实际的会计处理应根据企业的具体情况和合同条款，结合企业会计准则进行判断。这里假设了企业有足够的财务资源在到期时支付剩余的60%，并且这部分金额在财务报表中被记录为一项负债，直到实际支付时才进行调整。在实际操作中，企业可能需要根据其内部政策和外部审计建议来调整这些分录的具体科目和处理方式。