当孙公司变为子公司时，会计处理通常涉及将孙公司的资产、负债和所有者权益按照一定的公允价值或账面价值并入母公司的财务报表。具体处理方式如下：

1. 如果是通过购买孙公司额外股权实现控制，那么母公司将按照《企业会计准则第2号——长期股权投资》的规定，将对孙公司的投资从长期股权投资转换为合并财务报表中的子公司。购买日的公允价值与原长期股权投资账面价值之间的差额，调整资本公积，资本公积不足冲减的，调整留存收益。

2. 如果是通过非同一控制下的企业合并，母公司将确认新的商誉或损失，这取决于合并成本与取得的可辨认净资产公允价值的比较。

3. 对于孙公司原有的长期股权投资，母公司将终止确认，并确认一个新的长期股权投资，或者根据情况将其分类为其他金融资产。

4. 在合并财务报表中，需要抵销母子公司间的内部交易，调整未实现的损益，并处理相关的递延所得税影响。

5. 孙公司变为子公司前的留存收益、其他综合收益等所有者权益项目，需要根据购买日的公允价值或账面价值进行调整，并相应转入母公司的留存收益和其他权益类项目。

这些处理的依据是《企业会计准则》和相关解释，特别是关于企业合并、长期股权投资和合并财务报表的准则。在处理过程中，需要确保遵循会计的一致性和相关性原则，以准确反映合并后实体的财务状况和经营成果。