当承租人租入的设备进行改造并产生了长期待摊费用，而出租人在两年后决定出售设备给第三方时，承租人可能会收到一部分改造费用的补偿。在这种情况下，承租人的账务处理如下：

1. 当收到改造费用的补偿时，承租人应终止确认相应的长期待摊费用的账面价值。借记“银行存款”或其他相关科目，表示收到的补偿金额。
2. 同时，贷记“长期待摊费用”，反映这部分费用的摊销已完成，因为设备不再由承租人使用，所以不再摊销。
3. 如果补偿金额超过长期待摊费用的账面价值，超出部分应确认为收益。借记“长期待摊费用”，贷记“营业外收入”或其他相关收益科目。

请注意，具体的会计处理可能需要根据实际情况和适用的会计准则进行调整，例如，如果补偿金额小于长期待摊费用的账面价值，可能需要确认损失。同时，如果涉及关联方交易，还需考虑关联方交易的披露要求。