根据企业会计准则第3号——投资性房地产（2006）的规定，当投资性房地产的用途发生改变，如从出租转为自用，企业可以将投资性房地产转换为自用房地产。因此，如果两年后你们公司的经营性质发生变化，决定将原本用于出租的投资性房地产自用，可以进行转换。在成本模式下，投资性房地产转换为自用房地产时，应当将房地产转换前的账面价值作为转换后的入账价值（企业会计准则第3号-投资性房地产-第十四条）。如果之前采用的是公允价值模式计量，转换为自用时，应以其转换当日的公允价值作为自用房地产的账面价值，公允价值与原账面价值的差额计入当期损益（企业会计准则第3号-投资性房地产-第十五条）。所以，你们可以根据实际情况，按照上述准则进行相应的会计处理。