根据提供的信息，A公司通过信托B公司投资的虚拟货币项目，其价值可计量且根据虚拟货币市场的价值确定。因此，虚拟货币应按公允价值计量。在会计处理上，当A公司购买虚拟货币时，可以做如下记录：

借：无形资产 - 虚拟货币投资（公允价值） 贷：其他货币资金 - 信托存款（1,000,000）

后续如果虚拟货币的价值发生变化，需要根据公允价值调整账面价值，公允价值的增加或减少将计入当期损益。例如，如果虚拟货币的公允价值上升，会计处理如下：

借：无形资产 - 虚拟货币投资（增加额） 贷：公允价值变动损益（增加额）

如果虚拟货币的公允价值下降，会计处理则相反：

借：公允价值变动损益（减少额） 贷：无形资产 - 虚拟货币投资（减少额）

请注意，虚拟货币的会计处理可能会因监管环境和会计准则的变化而有所不同，因此实际操作中应参照最新的会计准则执行。