同一控制下企业合并和非同一控制下企业合并的主要区别在于合并的会计处理和计量基础：

1. 同一控制下企业合并：
2. 合并方按被合并方在最终控制方合并财务报表中净资产的账面价值份额确认长期股权投资。
3. 不产生新的商誉，因为合并是基于账面价值，而非公允价值。
4. 合并报表中，资产和负债按账面价值反映，不考虑公允价值调整。

5. 比较报表通常追溯调整至共同控制开始的时间。

6. 非同一控制下企业合并：

7. 合并方按支付的对价公允价值确认长期股权投资，可能产生商誉。
8. 被合并方的资产和负债按公允价值计量，与账面价值的差额可能导致商誉或损益。
9. 合并报表中，内部交易和未实现损益需要抵销处理。

这两种合并反映了不同的会计假设，同一控制下合并更强调实体的延续性，而非同一控制下合并则更注重市场价值和购买概念。