根据企业会计准则第20号-企业合并，当B公司将A公司的全部股权转让给C公司时，由于B和C公司属于同一控制下，这属于同一控制下的企业合并。在这种情况下，合并方（C公司）应当按照取得被合并方（A公司）所有者权益账面价值的份额，借记长期股权投资科目，按支付的合并对价的账面价值，贷记有关资产或借记有关负债科目。

对于B公司的个别财务报表，由于A公司的股权转让给了C公司，B公司应当将对应的长期股权投资账面价值转出，并确认投资收益或损失。具体会计分录为：借：银行存款2000万；贷：长期股权投资1000万、投资收益1000万（2000万出资额减去1000万账面价值）。

对于C公司的个别财务报表，C公司应当确认新的长期股权投资。具体会计分录为：借：长期股权投资1000万（按照B公司账面价值）；贷：银行存款2000万、资本公积1000万（出资额减去账面价值）。

当集团将C公司整体转让给第三方时，需要根据转让的条款和条件，以及C公司的账面价值和转让价格，来确定是否产生投资收益或损失。具体的会计处理取决于转让的具体情况，包括C公司的公允价值、转让价格以及C公司在转让时的净资产等信息。如果转让价格高于C公司的账面价值，则集团会确认投资收益；如果转让价格低于C公司的账面价值，则会确认投资损失。具体的会计分录需要根据实际交易的详细信息来确定。