根据提供的参考条款，没有直接相关的信息关于企业公章备案纸丢失的处理方法。然而，可以参考一般的企业管理实践和相关法律规定来处理此类情况。

1. 报案：首先，应由法人代表或授权代表携带身份证原件及复印件、工商营业执照副本原件及复印件到丢失地点所辖的派出所报案，并领取报案证明。

2. 登报声明：接下来，应持报案证明原件及复印件，工商营业执照副本原件及复印件在市级以上每日公开发行的报纸上做登报声明，声明公章备案纸作废。

3. 重新备案：在完成上述步骤后，应联系相关部门或机构，按照规定的程序重新申请公章备案纸。

4. 注意法律风险：在整个过程中，企业应注意可能涉及的法律风险，并采取适当的措施以防止可能的滥用或不当使用。

以上步骤是基于一般的企业管理实践和法律规定，具体操作可能需要根据当地的具体规定和流程进行调整。建议在处理此类问题时，咨询专业的法律顾问或相关部门以确保合规操作。