根据企业会计准则第18号——所得税（2006）-第一章 总则-第二条：本准则所称所得税包括企业以应纳税所得额为基础的各种境内和境外税额。因此，如果您的公司在境外销售SaaS服务并产生了收入，可能需要根据当地税法规定支付相应的所得税。至于是否需要代扣代缴所得税，这取决于德国和瑞士的税法规定以及您公司与客户之间的合同条款。通常，如果境外单位或个人在境内发生应税行为，且在境内未设有经营机构，购买方可能需要作为增值税扣缴义务人。但根据您提供的信息，软件部分并未涉及关税，且服务部署在境外，因此可能不涉及代扣代缴所得税的问题。建议咨询当地税务顾问或会计师以获取更准确的税务指导。