当母公司收购子公司部分少数股东股权时，合并层对少数股东权益的影响体现在以下几个方面：

1. 长期股权投资调整：根据企业会计准则，母公司个别财务报表中，新取得的长期股权投资成本与按照新增持股比例计算应享有子公司自购买日（或合并日）开始持续计算的可辨认净资产份额之间的差额，应当调整合并财务报表中的资本公积，资本公积不足冲减的，调整留存收益。

2. 少数股东权益变化：在合并财务报表中，子公司所有者权益中不属于母公司的份额，即少数股东权益，会因母公司收购少数股权而减少。收购后，少数股东在子公司中的权益比例下降，相应地，合并财务报表中的少数股东权益也会减少。

3. 少数股东损益影响：收购后，母公司对子公司的控制权增强，但少数股东损益的计算仍基于少数股东在子公司中的剩余股权比例，因此，这部分损益在合并利润表中会相应减少。

4. 资本公积或留存收益调整：由于收购价格可能高于或低于子公司净资产的公允价值，这会导致资本公积或留存收益的调整，进而影响合并财务报表的所有者权益结构。

综上所述，母公司收购少数股东股权会直接影响合并财务报表中的少数股东权益数额，同时可能对资本公积和留存收益产生影响。